Esta iglesia fue realizada gracias a la Cofradía del Sufragio y creada con el fin de ofrecer oraciones en sufragio por las almas de los difuntos.
La cofradía había nacido en 1592 en la parroquia de San Biagio alla Pagnotta, reconocida en 1594 por papa Clemente VIII y luego transformada en Archicofradía por papa Pablo V.
Luego, debido al aumento del número de fieles, se hizo necesario construir una nueva sede, la cual, gracias a las donaciones de los hermanos y a una herencia del marqués Bartolomeo Ruspoli, permitió construir la iglesia de Santa Maria del Suffragio.
