Esta igreja foi construída graças à Confraria do Sufrágio, e criada com o objetivo de rezar pelas almas dos defuntos. A confraria nasceu em 1592 na paróquia de San Biagio alla Pagnotta reconhecida em 1594 pelo Papa Clemente VIII e depois transformada em Arquiconfraria pelo Papa Paulo V. Mais tarde, dado o aumento do número de fiéis, tornou-se necessária uma nova sede, e graças às doações dos irmãos e um legado do Marquês Bartolomeo Ruspoli, a igreja de Santa Maria del Suffragio viu a luz.
