公元4世纪，君士坦丁皇帝成为这座大教堂的赞助者，他将其命名为“宗徒圣殿”（Basilica Apostolorum），为了纪念宗徒圣伯多禄与圣保禄。他们的圣髑自公元3世纪瓦勒良（Valeriano）的迫害以来就已经在这里保存了约50年。
后来才改名为圣巴斯弟盎教堂，以纪念戴克里先（Diocleziano）时期殉道的士兵。位于附近墓窟中的殉道者遗体加深了人们对他的敬礼。
1714年，教宗格肋孟十一世（Clemente XI）把它变成了教区教堂，并委托熙笃会（cistercensi）的修士来照顾它。1826年，教宗良十二世（Leone XII）将它交给方济小兄弟会（Ordine dei Frati Minori）的神父们照管，他们至今仍在照管它。
最后，在1957年5月3日，教宗庇护十二世（Pio XII）宣布圣巴斯弟盎成为意大利交通警察的主保。即使在今日，在1月20日圣巴斯弟盎的节日中，罗马首都警察部队也会以庄严的礼仪来庆祝这位圣人。
