A igreja faz parte de um grande complexo de edifícios que inclui a casa onde Santa Brígida da Suécia viveu desde 1350 com sua filha Santa Catarina. Após sua morte em 1373, o edifício foi confiado ao mosteiro sueco de Vadstena.
No entanto, quando a Suécia abraçou a fé luterana por volta de 1500, a relação com o mosteiro se desfez e o complexo foi ocupado por Olao Magno, arcebispo de Uppsala no exílio.
A igreja e o complexo mudaram de administração várias vezes, por exemplo, em 1589, o Papa Sisto V os deu a Sigismundo III Vasa, rei da Polônia e rei católico da Suécia, ou no final do século XX até 1931 passou para os carmelitas de Madre Edwige Wielhorski, para depois ser definitivamente entregue às freiras Brigidinas por concessão do Papa Pio XI.
Cada um desses proprietários realizará várias restaurações e modernizações tanto da igreja quanto das salas relacionadas à vida de Santa Brígida.
Até hoje a igreja continua sendo a igreja nacional dos suecos.