Pierwotnie kościół przyjął nazwę „Trinità del Monte”, najprawdopodobniej od rzymskiego wzgórza Pincio, na którym stoi. Prace budowlane przy pierwszej konstrukcji zakończono konsekracją dokonaną przez papieża Sykstusa V w roku 1585. Powierzył on także słynnemu architektowi Domenico Fontanie projekt budowy drogi łączącej kościół ze świątynią „Santa Maria Maggiore” (Bazylika Matki Bożej Większej). Fontana, biorąc pod uwagę różnicę wysokości powstałą w wyniku prac wykopaliskowych, zadbał również o zaprojektowanie schodów monumentalnych (zwanych dziś Schodami Hiszpańskimi) i dwóch ramp, które do dziś gwarantują dostęp do kościoła.
Obok kościoła stoi klasztor ufundowany przez Franciszka z Paoli w 1494 roku, wybudowany za fundusze jakie otrzymał on od korony francuskiej za gościnę francuskich zakonników z Zakonu Braci Mniejszych w tamtych latach.